Visų specialybių mokiniai turi galimybę šalia pagrindinio, mokytis groti papildomu instrumentu. Tai padeda ugdyti bendruosius muzikavimo gebėjimus bei suteikia antrojo muzikos instrumento muzikavimo patirtį.

Pagrindiniu antruoju muzikos instrumentu rekomenduojamas fortepijonas, tačiau, atsižvelgiant į mokyklos tradicijas ir turimas mokymo priemones, mokykla gali siūlyti ir kitą instrumentą. Pagrindinė šios metodinės grupės užduotis – sudaryti galimybes muzikavimą styginiais, liaudies, pučiamaisiais, mušamaisiais instrumentais ar dainavimą pasirinkusiems mokiniams pažinti klavišinius instrumentus.

Mokiniai, besimokantys groti papildomu instrumentu, dalyvauja įvairiuose mokyklos, o taip pat ir miesto renginiuose, tokiuose kaip „Žvėrelių karnavalas“, „Pavasarinės kaskados“ ir kt.

Papildomo instrumento metodinėje grupė dirba 10 pedagogų:

 Laima Krasauskaitė – metodinės grupės pirmininkė, mokytoja metodininkė (fortepijonas);

 Astra Bieliauskienė – mokytoja metodininkė (fortepijonas);

 Rasa Dikčiūtė – vyr. mokytoja (fortepijonas);

 Nijolė Gaidelienė – mokytoja metodininkė (fortepijonas);

 Irena Galkauskienė – mokytoja ekspertė (akordeonas);

 Aušra Kiuraitė-Svilainienė  – mokytoja (fortepijonas);

 Zenoida Paškevič – mokytoja metodininkė (akordeonas);

 Diana Vengerskaja – vyr. mokytoja (fortepijonas);

 Giedrė Vilutienė – mokytoja metodininkė (fortepijonas);

 Jolanta Žiemelienė – mokytoja metodininkė (fortepijonas).